PaDEL-descriptor是新加坡国立的Chun Wei Yap教授开发的用于计算分子描述符的软件。该程序基于JAVA语言,包括1875(1444个1D&2D描述符和431个3D描述符)个描述符以及12种分子指纹描述符。
Useage:
1.进入下载页面,点击下载软件包。
2.解压,双击PaDEL-Descriptor.jar。(须在装有JRE的情况下)
3.Molecules directory/file 中选择含有小分子文件的文件夹。
4.指定输出文件为csv格式。
5.选择要计算的分子描述符类型。
6.点击start,开始计算分子描述符。
Reference
1.PaDEL-descriptor mainpage
2.PaDEL-descriptor: An open source software to calculate molecular descriptors and fingerprints