小分子与蛋白体外相互作用测定方法

生物分子相互作用是一种基本的生命现象,其相互作用研究是现代生命科学研究的重大问题之一。现在研究相互作用的技术有:平衡透析法、紫外可见吸收光谱、荧光光谱、电化学法等。随着分子生药研究深入,一些新的检测技术问世,如微量热泳动技术(MST),那么当我们做蛋白相互作用时,面对如此多的技术,该如何让选择?笔者将目前测定小分子与蛋白的体外相互作用,最常用的四种技术:荧光偏振免疫分析法(fluorescence polarization immunoassay,FPIA)、等温量热滴定仪(ITC)、表面离子体共振技术(SPR)等技术的原理、操作、应用范围以及优缺点做一综述,供各位研究者参考。其中FPIA和ITC是两种经典方法。

通过绝对结合自由能预测配体选择性

安全药物的选择性在靶点验证过程中是非常重要的。选择性对于药物设计增添了不少的复杂性,因为它设计到多重结合亲和力的优化过程。从计算角度来讲,结合选择性预测是具有挑战性的,通用的方法仍无法使用。基于化学途径的绝对结合自由能计算为亲和力预测提供了框架。本文作者利用三个溴结构域抑制剂,评价了基于分子动力学模拟计算得到的自由能,并和等温滴定量热法数据进行了比较。
图1

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